PRODUCT

제품소개
SERVICE

16S & 18S rRNA
Identification Full Service

바이오팩트에서 진행하는 16S & 18S rRNA Identification full service는 미생물 동정에 관하여 genomic DNA isolation 부터 sequencing까지 실험 모두를 진행해 드리는 서비스입니다.

  • Feature

    • 신속한 결과 : Sample 접수 후 2 ~ 4일 이내에 결과 발송
    • 다양한 샘플 : Genomic DNA, colony 등 다양한 샘플에서 미생물 동정 가능
    • Full service : Genomic DNA 추출부터 sequencing, 그리고 informatics analysis까지 full service
    • 원인분석 Service : Fail result 에 따른 원인파악

    • 샘플 준비 방법 및
      의뢰 시 유의사항

      샘플 준비 방법 및 의뢰 시 유의사항
      비병원성 균주
      (Bacteria, Yeast)      		 병원성 균주 및 곰팡이 (방선균 포함) Genomic DNA 혹은 boiling한
      상태로만 접수 받는 샘플 종류
      • 순수 배양된 단일 colony 또는 genomic DNA
      		 순수 균주의 genomic DNA 추출이 힘들 경우 Boiling 후 보내 주시기 바랍니다.

      * Boiling 방법

      • 1.5 ㎖ tube에 균주 샘플과 TE buffer 혹은 무균수를 100 - 200 ㎕ 넣고 100℃에서 10–15min 물중탕
      • 곰팡이, 방선균, 병원에서 보내주는 샘플
      • Bacteria 인지 곰팡이 인지 알 수 없는 균주
      • 균주 특성상 바이오팩트 방법으로 DNA 추출이 어려운 경우 (only gDNA)

    • 실험 및 샘플보관 기간

      • 실험 기간 : 샘플 수령 후 2 - 4일 이내에 실험 완료 및 결과 전송
      • Sequencing data : 결과 전송 후 6개월 보관
      • 샘플 보관 : 1주일 (gDNA일 경우 - 사전 별도 요청 시 1달 보관 가능)
      • 샘플 반송 : order sheet에 기입해 주시거나 1주일 이내에 연락 주세요.

    • 결과 전송

      • 샘플 수령 후 2 - 4일 이내에 실험 완료 및 결과 전송
      • 제공 data
        • Sequencing data (ab1, seq 파일)
        • Informatics analysis 파일
        • (고객 추가 요청 시 추가 전달, assembly, Blast search)

  • Work Flow

    • STEP.01gDNA 추출

    • STEP.02PCR (유전자증폭) 및 정제

    • STEP.03전기영동

    • STEP.04염기서열분석

  • 미생물 동정에 사용되는 rRNA Gene region

    • Bacteria , 유산균 등

      16S rRNA Primer list (Universal)
      27F AGAGTTTGATCCTGGCTCAG
      337F GACTCCTACGGGAGGCWGCAG
      518F CCAGCAGCCGCGGTAATAC
      785F GGATTAGATACCCTGGTA
      518R GTATTACCGCGGCTGCTGG
      783R GTGGACTACCAGGGTATCTA
      805R GACTACCAGGGTATCTAATC
      907R CCG TCA ATT CMT TTR AGT TT
      1492R TACGGYTACCTTGTTACGACTT

    • Archaea 등

      23S rRNA Primer list (Archaea)
      1F TCCGAATGGGGAAACCC
      9F AAGAGGGAAACARCCCAGA
      10R GACCAGTGAGCTRTTAC
      16R GGAACTTACCCGACAAGG
      23R TTCGTGCTTAGATGCYTTCA
    • 16s-Archaea rRNA Primer list
      21F TTCCGGTTGATCCYGCCGGA
      344F ACGGGGCGCAGCAGGCGCGA
      1492R TACGGYTACCTTGTTACGACTT

    • Fungi, Yeast 등

      ITS
      ITS1 TCCGTAGGTGAACCTGCGG
      ITS4 TCCTCCGCTTATTGATATGC
    • 18S rRNA
      NS1 GTAGTCATATGCTTGTCTC
      NS8 TGTTACGACTTTTACTT
    • 25S~28S rRNA
      NL1 GCATATCAATAAGCGGAGGAAAG
      NL4 GGTCCGTGTTTCAAGACGG
      LROR ACCCGCTGAACTTAAGC
      LR7 TACTACCACCAAGATCT
      LR12 GACTTAGAGGCGTTCAG

      • ※ 다른 region 으로 분석하기 원하실 경우 1670-5695로 연락주세요.

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